PRESTO安装流程 | 组内xray/脉冲星入门教程

realfft.c: 在函数‘main’中: realfft.c:70:5: 错误：只允许在 C99 模式下使用‘for’循环初始化声明 for (int fi = 0 ; fi < numfiles ; fi++) { ^ realfft.c:70:5: 附注：使用 -std=c99 或 -std=gnu99 来编译您的代码 make: *** [realfft.o] 错误 1

realfft.c:7:21: 致命错误：clk_tck.h：没有那个文件或目录

致命错误：fitsio.h：没有那个文件或目录

ModuleNotFoundError: No module named 'distutils.msvccompiler’

与FFT相关的内核爆炸

tempo: error while loading shared libraries: libgslcblas.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory

问题

cpgplot.h: No such file or directory

一个简单的办法是，看是哪一步报错，建立软连接到对于文件夹，便可以正确识别

或

export CPLUS_INCLUDE_PATH=$PSRSOFT_DIR/include:$CPLUS_INCLUDE_PATH

psrchive中低版本的gcc：

提示：

编译添加选项：

高版本的问题：

../../Util/epsic/src/util/true_math.h:33:14: error: expected unqualified-id before 'sizeof' inline int signbit (float x) { return true_signbit_float(x); }

在编译过程中，true_math.h 中定义的 signbit 函数与系统头文件中的 signbit 宏或函数发生冲突。由于某些数学库（如 math.h 或 cmath）可能将 signbit 定义为宏，导致编译器在处理函数定义时错误地展开宏，引发语法错误。

修改true_math.h：防止重复的signbit 定义

或添加(不推荐)到true_math.h：

psrchive提示./psrchive.i:94: Error: Syntax error in input(1).

由于 swig3 与 swig-2.0.10 冲突，最直接的办法是 先卸载旧版本，再安装 swig3：

No module named 'numpy.distutils'

PSRCHIVE installation not found.

./configure --prefix=$PSRSOFT_DIR F77=gfortran CFLAGS=-fPIC FFLAGS=-fPIC

其中会改变某个文件的权限，但没用权限更改，所以报错

使用sudo，会找不到psrchive的路径依赖。。。。。。

sudo su进入root用户发现tempo也无法使用

解决办法：将.bashrc里关于软件的环境变量全部export一些，然后就没报错了

加速搜寻没能成功生成.cand0文件

可能是内存溢出

Note: If the following fails, edit $PRESTO/Makefile and follow the instructions about the CFLAGS USE_FFTW_MALLOC option

undefined reference to `__exp_finite'

Link errors with -ffast-math (-ffinite-math-only) and glibc 2.31

Recently, glibc (namely with glibc 2.31, included in Ubuntu 20.04) seems to have removed families of functions like __exp_finite(). These functions were used when compiling with gcc's option -ffinite-

https://stackoverflow.com/questions/63261220/link-errors-with-ffast-math-ffinite-math-only-and-glibc-2-31

dspsr：

以及CFITSIO不匹配的问题:

ERROR: Mismatch in the CFITSIO_SONAME value in the fitsio.h include file that was used to build the CFITSIO library, and the value in the include file that was used when compiling the application program: Version used to build the CFITSIO library = 8 Version included by the application program = 5

这个问题主要是先安装了heasoft之后，再安装presto出现的。heasoft自带10版本的最新的cfitsio，容易误链接。

参考

Pulsar 参考 --- Pulsar Reference

在 Linux 下将 PGPLOT 用于交互式图形 --- Using PGPLOT for interactive graphics under Linux